SNP選擇問(wèn)題研究
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標(biāo)簽：
研究復(fù)雜疾病與SNP之間的相關(guān)性是生物信息學(xué)最為重要的任務(wù)之一，然而基因分型的巨大花費(fèi)卻限制了其發(fā)展及應(yīng)用。因此，選擇部分有代表性的SNP（即標(biāo)簽SNP選擇問(wèn)題）進(jìn)行研究，從而降低研究所需費(fèi)用就顯得十分必要。近年來(lái)，已有一些算法被提出用于解決該問(wèn)題，但是大多數(shù)方法在預(yù)測(cè)精度及標(biāo)簽選擇數(shù)目等指標(biāo)方面仍未能達(dá)到實(shí)際應(yīng)用的需求。據(jù)此，設(shè)計(jì)了一種前向矩陣法用于標(biāo)簽SNP的選擇，并用改進(jìn)的PSO算法對(duì)非標(biāo)簽SNP進(jìn)行預(yù)測(cè)。最后通過(guò)大量數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)表明了算法與常用方法相比可選擇更少的標(biāo)簽，同時(shí)可獲得更高的預(yù)測(cè)精度，即在性能方面有了明顯的提升，更適合于標(biāo)簽SNP選擇問(wèn)題的研究。
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