基于K最近鄰和粒子群算法的單體型聚類(lèi)算法
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標(biāo)簽：粒子群算法(12952)聚類(lèi)算法(12092)
單核苷酸多態(tài)性（SNPs）是人類(lèi)遺傳變異中最顯著的一種形式，是一個(gè)物種中DNA序列中某個(gè)位點(diǎn)上的堿基變化。人們發(fā)現(xiàn)由單核苷酸組成的單體型比單一的單核苷酸包含更多的生物遺傳信息，因此研究單體型對(duì)于診斷疾病和藥物研制有著重要作用。單體型重建就是對(duì)由SNP片段組成的基因片段進(jìn)行組裝，從而構(gòu)造出原來(lái)的一對(duì)單體型。本文在K最近鄰和粒子群算法的基礎(chǔ)上，提出一種解決單體型重建問(wèn)題的一種聚類(lèi)算法。最后，本文將用模擬數(shù)據(jù)和真實(shí)數(shù)據(jù)來(lái)檢驗(yàn)本文所提出的算法，結(jié)果證明所提出的算法可行。
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