資料介紹
下一代測(cè)序技術(shù)( Next Generation Sequencing,NGS)以其低成本、超高通量的特性,顯著推動(dòng)著宏基因組學(xué)的發(fā)展,同時(shí)也為領(lǐng)內(nèi)科研人員帶來了巨大的挑戰(zhàn)。隨之而來的大規(guī)模、高復(fù)雜度測(cè)序數(shù)據(jù),讓研究人員在處理過程中面臨諸多困難面,大規(guī)模測(cè)序數(shù)據(jù)的分析消耗資源,如硬件資源、時(shí)間成本等;另一方面,計(jì)算分析過程中必然涉及到的大量宏基因組學(xué)計(jì)算分析工具很難由普通使用者自行部署、調(diào)試與維護(hù)。文中對(duì)比了領(lǐng)域內(nèi)主流的宏基因組學(xué)計(jì)算平臺(tái),綜合分析了各平臺(tái)主要的優(yōu)勢(shì)與不足;進(jìn)一步結(jié)合當(dāng)前有效的計(jì)算服務(wù)技術(shù),構(gòu)建完成了一個(gè)專注于宏基因組學(xué)計(jì)算分析的高可用彈性宏基因組學(xué)計(jì)算平臺(tái) MWS-MGA( More than a Web Service for Metagenomic Analysis);并通過提供多種交互接入方式以及豐富靈活的計(jì)算工具,較大程度地降低了科研人員進(jìn)行宏基因組學(xué)NGS數(shù)據(jù)分析的科研門襤。

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