NVIDIA宣布向全球所有COVID-19新型冠狀病毒研究人員免費提供90天的Parabricks軟件使用權(quán)
為應對新冠病毒疫情，NVIDIA宣布，將向全球所有COVID-19新型冠狀病毒研究人員免費提供90天的Parabricks軟件使用權(quán)。
NVIDIA Parabricks軟件基于著名的Genome Analysis Toolkit工具包，可通過GPU加速計算，將序列數(shù)據(jù)分析的速度提高50倍。
目前，各地科研人員正在對新狀病毒和COVID-19感染者的基因組進行測序，以了解疾病的傳播方式并確定易感染人群，但分析基因組序列需要耗費大量的時間和計算力。
Parabricks團隊去年12月剛剛加入NVIDIA，他們的軟件可以在一臺服務器上快速分析一個人的全部基因組變異，并且將分析時間從傳統(tǒng)的幾天，縮短至一個小時以內(nèi)。
鑒于此次疫情史無前例的傳播速度，如此巨大的提速無疑將對了解病毒進化、疫苗開發(fā)帶來巨大的推動作用。
NVIDIA也在聯(lián)系云服務供應商和超級計算中心，爭取提供更多的計算資源和Parabricks訪問途徑。
不過，只有使用NVIDIA GPU，才能申請并獲得Parabricks軟件的使用權(quán)。
另外，使用Oxford Nanopore long-read數(shù)據(jù)的研究人員，可以GitHub上找到GPU加速工具存儲庫，以下應用也已內(nèi)置NVIDIA GPU加速功能：Medaka、Racon、Raven、 Reticulatus、Unicycler。
責任編輯：wv
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