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昇思MindSpore蛋白質結構預測模型研發(fā)進展

7riU_gh_3a181fa ? 來源:華為計算 ? 作者:華為計算 ? 2022-04-24 12:13 ? 次閱讀
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近期,基于全場景AI框架昇思MindSpore 開發(fā)的蛋白質結構預測模型在全球持續(xù)蛋白質結構預測競賽CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)上連續(xù)三周霸榜,并包攬月榜前二,顯示出昇騰AI基礎軟硬件平臺在AI for Science領域的強大能力。

超越AlphaFold2,連續(xù)保持全球第一排名!

由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學聯(lián)合舉辦的 CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn)——全球持續(xù)蛋白質結構預測競賽,被認為是蛋白質結構預測領域最重要的比賽之一。

CAMEO 競賽的規(guī)則是,每位參賽者需每周對 20 個由世界范圍內的結構生物學家最新破解出的蛋白質結構進行預測,其分數(shù)和名次每周都會進行在線更新。

因此,該競賽吸引來不少世界范圍內生物計算領域的前沿模型“選手”?;跁N思MindSpore AI框架訓練的蛋白質結構預測模型,一經(jīng)亮相,便領跑全球。在最近的三周CAMEO競賽中持續(xù)排名第一,意味著昇騰AI基礎軟硬件平臺在AI for Science領域的強大能力。

昇思MindSpore蛋白質結構預測模型研發(fā)進展

2021年11月,昇思MindSpore團隊與昌平實驗室、北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)和化學與分子工程學院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組聯(lián)合推出基于AlphaFold2算法的蛋白質結構預測推理工具,并在2022年2月實現(xiàn)訓練的全流程打通,效率同比提升2-3倍。

采用昇騰AI基礎軟硬件平臺后,在混合精度下,單步迭代時間由20秒縮短到12秒,性能提升超過60%。依托昇思MindSpore內存復用能力, 訓練序列長度由384提升至512。

在訓練精度接近AlphaFold2的基礎上,昇思MindSpore在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進,本次發(fā)布的蛋白質結構預測模型成績持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下CAMEO競賽第一,毫無疑問是昇思MindSpore在蛋白質結構預測領域的又一里程碑,在填補國產(chǎn)AI基礎軟硬件在蛋白質結構預測領域成績空白的同時,更加證明了其價值與優(yōu)越性。

未來,針對蛋白質結構預測問題,昇思MindSpore將攜手學術科研界更多合作伙伴,在蛋白質結構預測領域共同探索、持續(xù)突破,助力國內相關基礎研究,尤其是生命各分支學科的進步,推動創(chuàng)新制藥行業(yè)的發(fā)展。

昇思MindSpore

昇思(mindspore.cn)是新一代全場景AI開源框架,支持端、邊、云全場景靈活部署,開創(chuàng)全新的AI編程范式,降低AI開發(fā)門檻,旨在實現(xiàn)開發(fā)友好、運行高效、部署靈活三大目標,同時著力構筑面向全球的人工智能開源社區(qū),推動人工智能軟硬件應用生態(tài)繁榮發(fā)展。

原文標題:連續(xù)霸榜!昇思MindSpore蛋白質結構預測模型拿下全球競賽第一

文章出處:【微信公眾號:華為計算】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

審核編輯:湯梓紅

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原文標題:連續(xù)霸榜!昇思MindSpore蛋白質結構預測模型拿下全球競賽第一

文章出處:【微信號:gh_3a181fa836b6,微信公眾號:華為計算】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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