Cadence、Iambic Therapeutics 等 100 多家公司采用 NVIDIA AI 來推動計算機輔助藥物研發(fā)和生成式 AI 的發(fā)展。

現(xiàn)在，研發(fā)下一代療法的制藥和生物學研究人員可以用 NVIDIA BioNeMo 新增的生成式 AI 工具包以及全新方法來獲取其模型。

全新 BioNeMo 基礎模型可以分析 DNA 序列、預測由藥物分子引起的蛋白質形態(tài)改變，以及根據(jù) RNA 確定細胞功能。

這些模型可用于加速蛋白質結構預測、生成化學和分子對接預測，現(xiàn)已通過 NVIDIA NIM 以微服務形式提供。NVIDIA NIM 是 NVIDIA 在本次 GTC 上推出的一組推理模型，可通過 NVIDIA AI Enterprise 軟件平臺獲得。

不久，BioNeMo 模型也將在 AWS HealthOmics 上提供，這是一項專用服務，旨在幫助醫(yī)療健康和生命科學組織存儲、查詢和分析包括 DNA 和 RNA 在內的生物數(shù)據(jù)。

利用這些功能，藥物研發(fā)團隊可以輕松將生成式 AI 集成到他們的工作流中，以更好地理解和設計藥物分子，并減少對時間和資源消耗較大的物理實驗的需求。

BioNeMo 新增用于基因組學和蛋白質設計的基礎模型

BioNeMo 新增的這些基礎模型包括其初次推出的基因組學模型 DNABERT。該模型基于 DNA 序列進行訓練，可用于預測基因組特定區(qū)域的功能、分析基因突變和變異的影響等。

BioNeMo 中即將提供的第二個模型是 scBERT，該模型基于單細胞 RNA 測序數(shù)據(jù)進行訓練，用戶能夠將其應用于下游任務，例如預測基因敲除（刪除特定基因或使其失活）的影響或識別細胞類型（如神經(jīng)細胞、血細胞或肌肉細胞）。

BioNeMo 中新增的第三個模型是 EquiDock，它可以預測兩種蛋白質相互作用過程的 3D 結構，這對了解藥物分子是否有效至關重要。

全新微服務助力 AI 洞察

NIM 的容器化 AI 微服務目錄包含超過二十多個醫(yī)療健康模型。其中包括 DiffDock 和 ESMFold，前者可以預測潛在候選藥物及其候選蛋白質的 3D 結構，后者可以基于單個氨基酸序列預測蛋白質結構。

NIM 目錄中的另一個成員是 MolMIM，可以生成針對用戶定義的特性而優(yōu)化的候選藥物，甚至能夠設計出經(jīng)過優(yōu)化并且能夠與特定蛋白質靶點結合的分子。

開發(fā)者可以通過使用本地 NVIDIA 認證系統(tǒng)的 NVIDIA AI Enterprise 以及包括 AWS、谷歌云、Microsoft Azure 和 Oracle Cloud Infrastructure 等領先的云平臺，訪問生產(chǎn)級 NIM 微服務。

超過100家公司將由BioNeMo 提供技術支持的AI功能集成到藥物研發(fā)工作流中

NVIDIA BioNeMo 已得到全球 100多家公司的采用，其中包括：

Astellas Pharma：這家總部位于東京的公司使用 BioNeMo 來加速藥物研發(fā)應用的分子模擬和大型語言模型。該公司將使用 Tokyo-1 AI 超級計算機進一步推進其工作。

Cadence：總部位于加利福尼亞州圣何塞的 Cadence 是一家領先的計算軟件開發(fā)商，該公司正在將 BioNeMo 微服務與其 Orion 平臺集成，以加速分子模擬。

Iambic：這家總部位于圣迭戈的藥物研發(fā)公司已經(jīng)采用 BioNeMo，并會將其 NeuralPLexer 模型作為 BioNeMo Cloud API（應用編程接口）用于非商業(yè)用途，幫助研究人員預測蛋白質的 3D 結構會因藥物分子產(chǎn)生怎樣的變化。

Insilico Medicine：總部位于紐約的 Insilico 是 NVIDIA 初創(chuàng)加速計劃的高級會員，該公司已將 BioNeMo 集成到其 AI 加速藥物研發(fā)工作流中，開發(fā)了 30多種治療性藥物，其中六種處于臨床階段。

Recursion：這家位于鹽湖城的藥物研發(fā)公司是托管合作伙伴，通過 BioNeMo 提供其 Phenom-Beta AI 模型。該 Transformer 模型可從細胞顯微鏡圖像中獲取洞察，從而幫助研究人員更好地了解細胞功能。

Terray Therapeutics：這家位于南加州的生物科技公司使用 BioNeMo 來幫助開發(fā)多靶點結構化綁定模型，并在 NVIDIA DGX Cloud上訓練用于小分子設計的生成式 AI 模型。

審核編輯：劉清